一、組織架構

二、組織職掌
本中心設有動物、植物、棲地生態、經營管理、解說教育等5組,低、中、高海拔等3個試驗站以及秘書、主計、人事等3個室,業務職掌如次:
動物組:特有動物之分布、族群數量、形態、行為、繁殖、保存方法等之調查研究事項。
植物組:特有植物之分布、族群數量、形態、行為、繁殖、保存方法等之調查研究事項。
棲地生態組:特有生態體系、棲息地有關地質、水文等生態調查研究事項。
經營管理組:研究用特有動植物之飼養、培育、動原保存、典藏、繁殖、復育,試驗站管理及配合其他組之研究事項。
解說教育組:研究保育成果之發表與宣導、保育資訊之建檔管理、生態教育教材之製作、推廣、服務、展示、觀摩等事項。
秘書室:研考、議事、公共關係、文書、檔、印信、出納、事務管理、財產管理及其他不屬各組、室之事項。
主計室:辦理歲計、會計及統計事項。
人事室:辦理人事管理事項。