一、學術期刊或碩博士論文
楊燿隆、楊平世。2008。南山溪蝴蝶多樣性的相關因子分析。特有生物研究10(1):45-72。
楊燿隆。2006。運用地理資訊系統輔助野生動物資源調查資料輸入。生物科學。
楊燿隆、方懷聖。2006。蘭嶼地區港口馬兜鈴環境需求及重要種植區域初探。特有生物研究8(1):27-34。
廖光正、李明進。2002。集集大地震後蚯蚓大量爬出現象之解析。特有生物研究 4(1)：41-51。
楊吉宗、廖光正、許富雄。2001。圈飼台灣黑熊嗜食性初探。特有生物研究3：73-79。
C.F. Tsai, S.C. Tsai and G.J. Liaw. Two new species of protandric pheretimoid earthworms belonging to the genus Metaphire (Megascolecidae: Oligochaeta) from Taiwan. Journal of Natural History, 2000, 34, 1731-1741.
楊燿隆。1999。台灣中部地區蝴蝶資源綜論。特有生物研究1。

二、科普性文章
莊明德、周文杰、廖光正、李德旺、張君瑋。2008。利用河川棲地二維模式評估丁壩對河川棲地之影響。水保技術 3(2):49-59。
莊明德、周文杰、廖光正、李德旺、陳伊昱。2008。河川砌石固床工之技術推廣與應用案例介紹。自然保育季刊63:3-8。
李訓煌、陳有祺、莊明德、溫博文、廖光正、周文杰、李德旺、張世倉、陳榮宗。2007。河川棲地二維模式(River 2D)之應用研究(第一年)期末報告書。經濟部水利署水利規劃試驗所。
莊明德、李訓煌、陳有祺、朱達仁、廖光正、周文杰。2007。應用分布序列法探討河川棲地評估指標之適用性。台灣水利季刊55(3)：62-72。
楊燿隆。2006。假如保育是種商品。動物園雜誌。
廖光正、莊志宏、莊明德、李德旺。2006。以水治水---以仙?溪砌石丁壩工為例。自然保育季刊 第55期，第25-29頁。
李訓煌、陳有祺、莊明德、廖光正、周文杰、劉靜榆、朱達仁、王偉德、張睿昇、汪淑慧、李德旺、張世倉。2006。台灣地區河川棲地評估技術之研究(第二年)期末報告書。經濟部水利署水利規劃試驗所。
李訓煌、陳有祺、莊明德、廖光正、周文杰、劉靜榆、朱達仁、王偉德、張睿昇、汪淑慧、李德旺、張世倉。2005。台灣地區河川棲地評估技術之研究(第一年)期末報告書。經濟部水利署水利規劃試驗所。
廖光正。2004。中寮的生態社區營造。環境綠化41。
廖光正。2004。談傳統砌石技術之現代價值。自然保育季刊46:16-23。