一、學術期刊或碩博士論文
范孟雯、林瑞興、黃雅倫、林德恩*。2006。台灣外來種陸域脊椎動物風險評估系統。特有生物研究8(2):7-22。
Lin, C. F., Y. L. Chen. & Y. F. Tsai. 2004. A production of four successive clutches of eggs by a female grass lizard (Takydromus stejnegeri van Denburgh) in captivity. Endemic Species Research Vol.6(2) 35-40.
陳元龍、楊吉宗. 2002. VOL4(2). 台灣地區野生及圈養台灣黑熊遺傳變異之初探. Pp.73-77. 特有生物研究
林德恩。1997。不同海拔梭德氏蛙蝌蚪耗氧量的比較。國立台灣大學動物研究所碩士論文69頁
Tsai, H. J. & Y. L. Chen. .(1994)Molecular cloning and characterization of complementary DNA encoding for the gonadotrophin α-subunit of yellowfin porgy (Acanthopagrus latus). J.Fish.Biol 44, 429-438.(SCI)
Tsai, H. J. & Y. L. Chen. (1994)Engineering and expression in Escherichia coli cells of the cDNA encoding the gonadotropin α-subunit mature region of yellowfin porgy. J.Appl.Ichthyol. 10. 189-195.(SCI)

二、研討會論文或調查研究報告
林德恩*、曾惠芸。台灣原生淡水龜的爬坡能力。2008動物行為暨生態研討會-中國生物學會聯合年會。生物科學50(1):87頁。
林德恩*、杜銘章。入侵種多線南蜥溫度耐受度。2007動物行為暨生態研討會-中國生物學會聯合年會。61頁。
林德恩*、趙仁方、黃永慶、林登榮。2007。綠島地區道路殺手效應之研究。2007動物行為暨生態研討會-中國生物學會聯合年會。95頁。
林德恩*、趙仁方、林登榮、黃永慶。2007。綠島地區道路殺手效應之研究。綠島生物多樣性保育研討會論文集。
林德恩*、黃永慶、杜銘章。五種石龍子科蜥蜴在不同水深與水溫下的潛泳能力。2007動物行為暨生態研討會-中國生物學會聯合年會。138頁。
林德恩*。入侵種多線南蜥的生殖週期。2004生物、溪流環境、行為與生態聯合學術年會論文集。
林德恩*、黃文山。長尾南蜥親代照顧之研究。2002動物行為暨生態研討會論文集。
林德恩*、侯平君、林曜松。不同海拔梭德氏赤蛙蝌蚪耗氧量的比較。1997動物行為暨生態研討會論文集。

三、科普性文章
林德恩*。2008。多線南蜥研究現況介紹及防治建議。保育季刊61:30-36。
曾惠芸*、林德恩。2008。外來入侵種多線南蜥分布北界的調查記錄。保育季刊61:37-42。
陳元龍. 2007. 我與沿岸島蜥的奮戰----現在進行式. 自然保育季刊VOL.59.
林德恩*、趙仁方、林登榮、黃永慶。2007。綠島地區道路殺手效應之研究。繽紛綠島再發現-綠島生物多樣性保育研討會實錄。58-68頁。
陳元龍等. 2004. VOL.47. 荒月綠洲--台南縣龍崎鄉埤仔溝溪集水區之生物? 資源簡介. 自然保育季刊
林德恩*。2004。小蘭嶼兩棲爬蟲類發現記。保育季刊45:31-34。
林德恩*、黃國峰。2004。我要活下去！淺談蜥蜴如何躲避天敵。保育季刊48:51-57。
林德恩*。2004。台灣的蜥蜴。少年台灣，牛頓雜誌出版社。
陳元龍. 2002. VOL.38. 台灣的六大毒蛇. 自然保育季刊
陳元龍. 2001. VOL.35. 921震後九九峰的哺乳動物相. 自然保育季刊
陳元龍. 1999. VOL.28. 野生動物標示技術. 自然保育季刊
林德恩*。1995。吳郭魚背鰭的再生。NOW。

四、出版品（書籍、影帶、DVD、手冊、摺頁等）
林德恩*、陳元龍、曾惠芸、蔡忠穎。2007。「不蜥—入侵種多線南蜥研究現況介紹及防治建議」解說摺頁。
陳元龍等。2006。台北及基隆縣市野生動物.. （爬蟲類部份）
陳元龍等。2005。宜蘭縣的野生動物.（主編、爬蟲類部份）
陳元龍等。2005。有鳳來儀—飛鳳山生態教育園區。（摺頁）（主編）
陳元龍等。2005。桃園縣的野生動物（爬蟲類部份）
陳元龍等。2005。有鳳來儀—飛鳳山生態教育園區解說手冊。芎林鄉公所、行政院農業委員會特有生物研究保育中心出版.2005。（主編）
陳元龍。「生態危機—入侵台灣的外來種動物」DVD影片. 2003.（執行製作）.
陳元龍。2004。清水蘊生機—南投縣中寮鄉樟平溪的生物多樣性。（摺頁）
陳元龍。2003。荒月綠洲--台南縣龍崎鄉埤仔溝溪集水區之生物多樣性。 （摺頁）
陳元龍等。2003。台灣保育類野生動物圖鑑.（爬蟲類部份）
陳元龍等。2002。新竹縣市野生動物.. （爬蟲類部份）
陳元龍等。2002。卡那卡那富鄉土誌..（爬蟲類部份）
陳元龍等。2001。屏東縣的野生動物.. （爬蟲類部份）